《米小圈上学记之童年时光机》讲述了小学生米小圈和他的朋友们在学校和生活中经历的奇妙冒险故事。影片以现代小学生活为背景，融合了奇幻元素，展现了孩子们纯真的友谊与成长困惑。

故事围绕米小圈意外获得一台神奇的“童年时光机”展开，这台时光机能够带他回到过去的美好时光，也带来许多意想不到的挑战。米小圈和他的伙伴们借助时光机，重温童年趣事，解决误会，增进彼此间的理解与信任。

米小圈机灵开朗，是团队的核心人物；他的好友王小明幽默善良，常为大家出谋划策；还有活泼好动的小芳，带给大家无限欢乐。影片的重要转折点出现在时光机突然失控，孩子们面临困境时，大家齐心协力合作，最终成功化解难题。故事在温馨感人的结局中，传递了珍惜当下、勇敢面对成长的主题。